內(nèi)設(shè)辦公室（計(jì)劃財(cái)務(wù)科、財(cái)務(wù)核算中心）、業(yè)務(wù)科技科（三明市人工影響天氣辦公室）、政策法規(guī)科（三明市防雷辦公室）、人事教育科（監(jiān)察審計(jì)科、精神文明建設(shè)辦公室）4個職能科（室）。三明市氣象臺（三明市環(huán)境預(yù)報中心）、三明市氣象科技服務(wù)中心（三明市專業(yè)氣象臺）、三明市防雷中心（三明市防雷減災(zāi)管理局）、三明市氣象科技開發(fā)中心4個直屬單位。永安市氣象局、明溪縣氣象局、清流縣氣象局、寧化縣氣象局、沙縣氣象局、尤溪縣氣象局、大田縣氣象局、將樂縣氣象局、泰寧縣氣象局、建寧縣氣象局等10個縣（市）級氣象局。
