克州氣象局管理體制從1955—1971年經(jīng)歷了由氣象部門到地方政府管理、再到氣象部門領導為主的雙重領導體制的演變；1971—1974年實行軍隊和地方同級革命委員會領導，業(yè)務受上級氣象部門指導。1974年3月成立克州氣象局，實行以氣象部門為主、氣象部門和地方政府雙重領導的管理體制。
克州氣象局黨組新一屆班子2007年11月組建，現(xiàn)有成員4名，其中黨組書記、局長一名，班子其他成員3名。
克州氣象局下轄4個縣（市）氣象局，4個國家氣象觀測站。其中，國家基本氣象站3個（阿圖什、阿合奇、烏?。?/SPAN>，國家一般氣象站1個（阿克陶）。4個氣象站的資料參加國內(nèi)交換。共有兩個艱苦氣象站（烏恰為國家二類艱苦氣象站，阿合奇為國家三類艱苦氣象站）。2009年建成5個區(qū)域自動氣象站。2010年7月建成了空間天氣監(jiān)測——電離層測高儀站。局機關內(nèi)設5個科室（辦公室、業(yè)務科、計劃財務科、法規(guī)科、人事科），3個直屬事業(yè)單位（氣象臺、科技服務中心、后勤中心）
主要開展的業(yè)務有：基礎測報業(yè)務、預報服務、防災減災、防雷減災、人工影響天氣等。
地面測報業(yè)務已從過去簡單的人工觀測發(fā)展到現(xiàn)在的人工和自動化相結合的綜合觀測體系。
預報服務業(yè)務從初期單純的天氣圖加經(jīng)驗的定性預報，逐步發(fā)展為采用氣象雷達、衛(wèi)星云圖、并行計算機系統(tǒng)等先進工具制作的客觀定量定點天氣預報。
氣象服務主要有公眾氣象服務、決策氣象服務、專業(yè)氣象服務和氣象防災減災服務四大類。氣象服務的主要內(nèi)容有天氣預報(特別是災害性、關鍵性天氣預報服務)、氣候分析，氣象資料和情報等。
公眾氣象服務主要是通過廣播、電視、報社、12121聲訊電話、網(wǎng)絡面向社會公眾發(fā)布天氣預報，指導公眾防災減災。
決策氣象服務主要是為黨政領導當好參謀，為農(nóng)牧業(yè)生產(chǎn)和指揮防汛抗旱等重要決策提供科學依據(jù)。服務的手段和內(nèi)容主要有天氣預報、情報、氣候分析、人工影響天氣等。
人工影響天氣技術由過去單一依靠人工觀測云層、采用“土火箭”發(fā)射碘化銀作業(yè)，發(fā)展到利用氣象衛(wèi)星、多普勒天氣雷達等先進探測手段，形成與車載式火箭、“三七”高炮作業(yè)相結合的新局面。
全州氣象部門現(xiàn)有編制（2001年定編）81人。截至2010年8月全州氣象系統(tǒng)共有職工120人，其中在職在編人數(shù)為79人，（不在編制3人，2009年分配的大專生）離退休人員38人。由維吾爾、漢、柯爾克孜、回、土家族、哈薩克族6個民族組成。本科學歷19人，大專學歷33人；高級工程師1人，工程師34人，助理工程師38人。中共黨員23人。
在歷屆黨組的正確領導和廣大干部職工的共同努力下，克州氣象局先后取得以下榮譽：1961年克州氣象臺被新疆維吾爾自治區(qū)農(nóng)牧戰(zhàn)線群英會授予“先進集體”。
1990年克州氣象局被國家民委授予“全國民族團結先進集體”。
1991年克州氣象局被自治區(qū)黨委、人民政府授予“民族團結先進集體”。
2001年克州氣象局被命名為自治區(qū)級文明單位。
2004年克州氣象系統(tǒng)被命名為自治州級文明行業(yè)。
1995—2009年先后被評為阿圖什市“社會治安綜合治理甲級單位”、“計劃生育合格單位”、社會治安綜合治理“安全文明單位”、“衛(wèi)生紅旗單位”。
在參與上級和地方組織的文體活動中多次獲獎。2006年參加全疆氣象部門南疆片文藝匯演獲三等獎和優(yōu)秀組織獎，同年9月參加全疆氣象系統(tǒng)老年乒乓球比賽獲三等獎；2010年3月參加克州農(nóng)業(yè)系統(tǒng)組織的若魯孜節(jié)文藝匯演獲一等獎。
